Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NacadQ5SWP3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NacadQ5SWP3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NacadQ5SWP3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NacadQ5SWP3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NacadQ5SWP3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NacadQ5SWP3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NacadQ5SWP3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
NacadQ5SWP3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NacadQ5SWP3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NacadQ5SWP3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms