Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tsr1Q5SWD9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tsr1Q5SWD9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms