Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tns3Q5SSZ5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tns3Q5SSZ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tns3Q5SSZ5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms