Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms