Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Utp18Q5SSI6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Utp18Q5SSI6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms