Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zzef1Q5SSH7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zzef1Q5SSH7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms