Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg7Q5RJH6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms