Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc1Q5NCF2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc1Q5NCF2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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