Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim58Q5NCC9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim58Q5NCC9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms