Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spata48Q5NC83 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spata48Q5NC83 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms