Protein–RNA interactions for Protein: Q5F226

Fat2, Protocadherin Fat 2, mousemouse

Predictions only

Length 4,351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fat2Q5F226 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Fat2Q5F226 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fat2Q5F226 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fat2Q5F226 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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