Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prss53Q571E5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prss53Q571E5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms