Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spire1Q52KF3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spire1Q52KF3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms