Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms