Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Khdc1cQ4KL78 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Khdc1cQ4KL78 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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