Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem171Q4KL18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem171Q4KL18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms