Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3lQ4KL14 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms