Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shank3Q4ACU6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shank3Q4ACU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms