Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms