Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms