Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp48Q3V0C5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms