Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5aQ3UXZ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5aQ3UXZ9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5aQ3UXZ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5aQ3UXZ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5aQ3UXZ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Kdm5aQ3UXZ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kdm5aQ3UXZ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms