Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clca4bQ3UW98 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clca4bQ3UW98 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms