Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clpsl2Q3UW21 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms