Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chpf2Q3UU43 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chpf2Q3UU43 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms