Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Obox3Q3UT54 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Obox3Q3UT54 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms