Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Znf48Q3US17 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znf48Q3US17 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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