Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acsf3Q3URE1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Acsf3Q3URE1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms