Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vwa5b2Q3UR50 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vwa5b2Q3UR50 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms