Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
E130208F15RikQ3UPV3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
E130208F15RikQ3UPV3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms