Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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D13Ertd608eQ3UPR8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms