Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shisa3Q3UPR0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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