Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlrc4Q3UP44 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlrc4Q3UP44 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms