Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdgfl2Q3UMU9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hdgfl2Q3UMU9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms