Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc33Q3ULW6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms