Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctsll3Q3ULP7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctsll3Q3ULP7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms