Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ell2Q3UKU1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ell2Q3UKU1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms