Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpr55Q3UJF0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms