Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b2Q3UJB0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms