Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm648Q3UJ22 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms