Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx3lQ3UIR3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx3lQ3UIR3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx3lQ3UIR3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx3lQ3UIR3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx3lQ3UIR3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx3lQ3UIR3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx3lQ3UIR3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx3lQ3UIR3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms