Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Greb1Q3UHK3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Greb1Q3UHK3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms