Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LchnQ3UHG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LchnQ3UHG7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms