Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rsph3aQ3UFY4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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