Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms