Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nom1Q3UFM5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nom1Q3UFM5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms