Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtpbp6Q3U6U5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtpbp6Q3U6U5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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