Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud5Q3U2S4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud5Q3U2S4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms