Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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