Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf149Q3U2C5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rnf149Q3U2C5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf149Q3U2C5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rnf149Q3U2C5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnf149Q3U2C5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnf149Q3U2C5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf149Q3U2C5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf149Q3U2C5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf149Q3U2C5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rnf149Q3U2C5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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